基因芯片与SNP技术区别
原理不同 SNP技术：首先，用聚合酶链反应（PCR）扩增含单核苷酸多态性的基因组片段，然后用序列特异性引物进行单碱基扩增。然后将样品分析物与芯片基体共结晶，在真空管中用瞬时纳秒（10-9s）激光进行激发。基因芯片：测序原理是杂交测序法，即用已知序列的一组核酸探针杂交的核酸测序法。
基因芯片与SNP技术区别：1 基因芯片 基因芯片的基本原理是应用已知的核苷酸序列作为探针与标记的靶核苷酸序列进行杂交，通过对信号的检测进行定性与定量分析。基因芯片可在一微小的基片（硅片、玻片等） 表面集成大量的分子识别探针，能够在同一时间内平行分析大量基因，进行大信息量的检测分析 。
SNP处理的技术手段主要包括基因芯片和测序技术，其中基因芯片是一种高通量、高精度的检测SNP标记的方法，一次可检测数万个标记。而测序技术则是利用DNA测序仪对DNA样本进行全面的测序，既能检测SNP标记，还能检测基因组其他变异。
一）、基因芯片技术基因芯片技术：是在固相支持介质上进行分子杂交和原位荧光检测的一种高通量SNP分析方法。优缺点：优点是高通量，一次可对多个SNP进行规模性筛选，被捡起始材料也很少，操作步骤简单。缺点是芯片设计成本高，由于DNA样品的复杂性，有些SNP不能被捡起。
ChIP技术：动态蛋白质-DNA关系的深入研究 ChIP （Chromatin Immunoprecipitation） 技术揭示了组蛋白修饰和基因表达之间的紧密关联，揭示基因调控的复杂网络。 基因芯片：基因表达的全方位检测 基因芯片如同一张DNA探针阵列，能对大量基因进行一次性的高通量检测，捕捉到基因表达的细微变化。
生物芯片如何检测基因表达
生物芯片技术的检测原理主要基于荧光标记和检测。这种技术利用DNA碱基在特定波长下的荧光特性，进行高效、准确的分析。在微阵列分析中，多色荧光标记能够同时处理多个生物样品，降低人为误差，提高基因表达和突变检测的准确性。荧光分析技术的应用，如共聚焦扫描的CCD照相，使得数据获取更加精细。
基因芯片上有很多目的基因的DNA片段，当检测时这些DNA实际上是和mRNA结合，即检测目的基因是否转录出对应的mRNA。虽然不管某基因表达还是不表达，它都是存在的，但表达的基因是会转录出转录RNA的，且不同时期不同基因所转录出mRNA的量是不同的，我们可以根据这些mRNA来寻找对应的DNA。
生物芯片技术，如同PCR技术一样，被广泛应用于基因表达检测。其基本流程图是检测基因表达，但其策略的潜力远远超出这一领域。除了基因表达分析，杂交技术还可用于基因突变检测、多态性分析、基因定位、进化研究等，甚至微阵列分析也能检测蛋白质与核酸、小分子物质以及蛋白质间的相互作用。
研究基因的表达主要有以下方法：分子生物学方法 基因克隆与测序。通过PCR等技术，扩增特定基因片段，再进行测序，可以确定基因序列及结构特征，为后续表达研究打下基础。 表达谱分析。利用基因表达芯片或高通量测序技术，检测不同组织或细胞类型中基因的表达水平，揭示特定基因的表达模式。
基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。
在一块很小的芯片上集成大量的生物分子探针，这些探针可以与特定的基因序列进行杂交反应。通过检测杂交信号，可以获取基因信息。基因芯片技术具有广泛的应用领域，包括疾病诊断、药物研发、基因功能研究等。它不仅可以用于遗传病的诊断，还可以用于病原体检测、肿瘤基因检测等。
基因芯片的相关技术
1、基因芯片技术 基因芯片技术是一种将基因信息高度集成在微小芯片上的生物技术。它结合了生物学、医学、计算机科学等多个领域的知识和技术，具有高效、快速、准确等特点。
2、SNP技术：时间飞行质谱（MALDI-TOF）完成的SNP检测准确率可达99%，除了准确性高、灵活性强、通量大、检测周期短等优势外，最有吸引力的应该还是它的性价比。基因芯片：快速、高效、自动化。
3、Sanger测序法：利用化学方法逐个分离、检测DNA序列中每个核苷酸，得到目标基因的完整序列。 下一代测序技术（NGS）：包括Illumina、Ion Torrent、Pacific Biosciences等多种技术，能够快速高效地测定大量DNA片段的序列。 PCR技术：通过引物扩增目标区域的DNA序列，以便进行检测和分析。
4、基因标记辅助选择育种：基因芯片技术可以帮助育种者快速地获取畜禽的基因型信息，并从中筛选出优良基因标记，实现基因标记辅助选择育种。基因表达谱分析：基因芯片技术可以帮助育种者分析畜禽不同发育阶段的基因表达谱，帮助研究者深入了解畜禽的基因调控机制和代谢通路，提高产蛋效率、增加肉鸡生长速度等。
5、生物芯片，又称蛋白芯片或基因芯片，它们起源于DNA杂交探针技术与半导体工业技术相结合的结晶。该技术系指将大量探针分子固定于支持物上后与带荧光标记的DNA或其他样品分子（例如蛋白，因子或小分子）进行杂交，通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。
