如何预测和鉴定miRNA的靶基因
其次,基于保守性的方法利用跨物种基因组序列比对,预测miRNA靶位点上的保守序列区域,识别可能的靶基因。PhyloP、PhastCons等工具适合进行此类保守性分析。再者,基于结构的方法考虑miRNA与靶基因的结构和稳定性,通过预测二级结构和自由能等参数,预测结合位点。RNAhybrid、miRanda等工具支持结构预测。
预测终归是预测,miRNA的靶基因还必须经过验证。这个过程与一开始寻找靶基因的过程相似,也就是抑制或过表达miRNA,然后检查mRNA或蛋白水平的反应。生物通 目前最常用的方法是荧光素酶报告基因法。
鉴定miRNA的靶基因是一项复杂但至关重要的任务。目前,最常用的方法是借助计算机算法,如TargetScan、MiRanda和PicTar等。这些算法主要依赖于对miRNA种子区(seedregion)的预测。种子区是miRNA上高度保守的片段,其核苷酸序列位于第2到第8位之间。这一区域对于miRNA与mRNA3’-UTR的互补结合至关重要。
准备细胞转染,将构建的载体与microRNA相关产品共转染细胞。荧光素酶检测,共转染细胞24-72小时后,通过检测确定目的microRNA的靶基因。解决实验中常见问题 如何判断转染成功?通过luc读值判断3 UTR质粒及Renilla质粒转染成功。
武汉中帜生物科技有限公司产品介绍
1、在科研试剂方面,武汉中帜生物科技有限公司是美国Signosis公司科研试剂的独家总代理,销售的产品近200种,尤其是在miRNA研究和转录因子研究领域,Signosis公司的产品处于行业前沿。miRNA研究涉及基因表达调控,miRNA在多种生物过程中起关键作用,如发育、细胞分化、增殖、凋亡、维持干性和印记等。
2、武汉中帜生物科技有限公司,一家由海外归国的生物科技专家创立,专注于分子生物检测与临床医学诊断新技术、新产品的研发、生产和销售的高新技术企业,注册资本高达3000万,涉足生命科学与医学临床检验领域。
3、武汉中帜生物科技股份有限公司的经营范围是:生物技术产品、医疗器械的研究与开发;实验室仪器设备、科研试剂的生产与销售;相关项目产品的技术咨询、技术转让、技术服务。(上述经营范围中国家有专项规定的项目经国家审批后或凭许可证在核定期限内经营)。
荧光素酶的作用原理及应用
1、荧光素酶作为自然界中能产生生物荧光的酶,其催化作用能将荧光素氧化成氧化荧光素,从而释放出生物荧光。通过荧光测定仪对荧光素氧化过程中的荧光进行测量,这一生物发光体系能极其灵敏且高效地检测基因的表达,成为检测转录因子与目的基因启动子区DNA相互作用的有力工具。
2、荧光素酶报告基因的应用原理主要基于基因表达和酶活性检测。其原理具体可以分为以下几个部分:报告基因概述 荧光素酶报告基因是一种用于生物学研究的工具,常用于检测基因的表达情况。报告基因的特点是能够表达并产生可检测的信号,这些信号如荧光信号可以直观反映目的基因的活动状态。
3、作用与优势:活体成像:通过荧光素酶标记,科学家可以非侵入性地追踪肿瘤的生长、转移和基因表达变化。成本效益高:相较于其他成像技术,荧光素酶标记细胞株的应用具有更高的成本效益。直观性:荧光素酶标记产生的发光现象与标记细胞数量成正比,使得成像结果直观易懂。
4、将荧光素酶报告基因载体转染到细胞中,可用荧光素酶检测系统测定荧光素酶基因的表达。荧光素酶报告基因的优点有非放射性、比CAT及其他报告基因速度快、灵敏度比CAT高100倍、半衰期短,因此启动子的改变会即时导致荧光素酶活性的改变,而荧光素酶不会积累。
5、通过改良的萤火虫荧光素酶,无需裂解细胞,也能实时监测酶活性,Renilla荧光素酶则因其膜透性和光裂解特性,成为活细胞研究的理想选择。\n\n荧光素酶报告基因的卓越之处在于它非放射性的优势,它的检测速度和灵敏度远超其他报告基因。例如,它比CAT报告基因快且灵敏100倍。
6、荧光素酶报告基因实验是生物学研究中,用于评估转录因子调控效应的一种关键技术。转录因子,作为基因表达的调控者,其独特的结构使其能够与特定的DNA序列,即顺式作用元件,发生结合,从而影响基因的开关调控。
如何在酶标仪上使用化学发光法检测细胞活性
1、测定方法很多,常见的有化学法、免疫法和等电点聚焦法。其中化学法应用最普遍,化学法的原理主要是利用有些化合物在自氧化过程中会产生有色中间物和O2 -,利用SOD分解而间接推算酶活力。
2、稳定,能持续一段时间;闪光型发光时间短,变化快,稳定性不强,需要应用自动加样器才可以进行,化学发光中发出的光子数与样品量呈一定比例关系。多功能酶标仪:是以上三种酶标仪的集合,集成了两种或者三种酶标仪于一体,可以同时进行光吸收,荧光和化学发光的检测,功能强大,使用范围广。
3、免疫反应系统是将发光物质(在反应剂激发下生成激发态中间体) 直接标记在抗原(化学发光免疫分析) 或抗体(免疫化学发光分析) 上, 或酶作用于发光底物。酶标仪即酶联免疫检测仪,是酶联免疫吸附试验的专用仪器。
4、一般金标是没有数值的,但是酶免法和化学发光法有。检测单上一般会有s/co值和od值。s/co值叫做酶标仪的内部定性判定参考值,其中s表示检测值,co表示临界值,只要s/co值不超过参考值(一般是1)那这次检测就是阴性:反之,大于参考值(一般是1)那就是阳性。另外,od值表示光密度。
双荧光素酶质粒共转染怎么做?
1、细胞培养和处理:选择合适的细胞系并进行培养。在进行共转染之前,需要对细胞进行预处理,例如根据实验需要进行细胞处理、刺激或诱导等。共转染:将构建好的双荧光素酶质粒与其他目标质粒(例如表达转录因子、信号分子等)一起转染入目标细胞。
2、构建报告基因质粒:将靶启动子片段插入萤火虫荧光素酶表达序列前方。共转染:将构建的报告基因质粒、内参质粒和转录因子过表达质粒共同转染至哺乳动物细胞。细胞培养与裂解:培养转染后的细胞,并裂解以释放荧光素酶。荧光检测:通过检测荧光强度来测定荧光素酶活性。
3、然后转染细胞,适当刺激或处理后裂解细胞,测定荧光素酶活性。通过荧光素酶活性的高低判断性刺前后或不同刺激对感兴趣的调控元件的影响。
4、酶标准曲线通过配制萤火虫和海肾荧光素酶的工作液和标准品进行,同时准备双荧光素酶检测试剂,用于冲洗注射器卡盒并进行加液操作。
5、双荧光素酶实验原理,通过荧光素酶与底物结合的化学发光反应,检测特定基因转录的调控元件。构建报告质粒,将目的基因置于萤火虫荧光素酶基因上游,转染细胞,处理后裂解,测定荧光素酶活性,评估不同条件对基因活性的影响。同时引入海肾荧光素酶作为内对照,确保实验结果准确性。
6、双荧光素酶检测实验步骤 步骤包括质粒构建、细胞转染、报告基因检测与数据分析。质粒构建时选择相应骨架载体,加入启动子或转录因子序列。细胞转染需根据实验目的选择瞬时或稳定转染方法,并保持主报告基因与内参基因比例适宜。报告基因检测通过荧光计数仪测定活性。
双荧光素酶应用实例(一)
1、结果显示,WRKY46明显抑制由完整ALMTI启动子(P1) 带动的荧光素酶的活性,但不影响5端缺失的启动子(P2) 带动的荧光素酶活性, 说明缺失的启动子序列(含6个W-box 元件)对WRKY46与ALMTI启动子的相互作用至关重要。例子4 例子5---启动子结构分析。
2、双荧光素酶报告基因检测是一种高效且灵活的生物研究工具,广泛应用于基因调控、非编码RNA靶向互作等领域。检测系统基于萤火虫荧光素酶(Firefly luciferase)和海肾萤光素酶(Renilla luciferase),两者的配合使用,使得检测灵敏度高、动态范围广,成为生物科研中的重要手段。
3、双荧光素酶报告基因实验是一种通过比较萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶的活性来研究基因表达调控的分子生物学技术。其关键点和实验流程如下: 实验原理: 核心原理:通过比较萤火虫荧光素酶和海肾荧光素酶的活性,揭示基因调控的动态过程。