常用的SNP检测方法有哪些
Taqman法：准确性高，适合于大样本、少位点，价格比较贵；质谱法：准确性高，适合于大样本、多位点（能检测25个位点）；芯片法：准确性较低，适合于超多位点分析；测序法：非常准备，但是价格也非常的高，但是对于少样本、超多位点还是非常好的选择。
现在SNP的常用检测方法主要有：Taqman法、质谱法、芯片法、测序法。
【答案】：错误[考点]鸟枪法的应用。鸟枪法是直接从已测序的小片段中寻找彼此重叠的测序克隆，然后依次向两侧邻接的序列延伸。而SNP是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态，这种差异包括单个碱基的缺失和插入，但更常见的是单个核苷酸的替换。
常用的技术手段包括： DNA分子杂交 、 引物延伸 、 等位基因特异的寡核苷酸 连接反应 、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术；（2）完成这些化学反应所采用的模式，包括液相反应、固相支持物上进行的反应以及二者皆有的反应。（3）化学反应结束后，需要应用生物技术系统检测反应结果。
Snippy 是一款用于SNP检测的软件，可以通过分析得到核心SNP，进行比对构建进化树。
DNA鉴定方法主要包括以下几种： 聚合酶链式反应（PCR）解释：PCR是一种在实验室中快速扩增特定DNA片段的方法。通过特定的引物与DNA模板结合，利用酶的作用，进行链式反应，将特定的DNA片段大量复制。这种方法广泛应用于DNA鉴定中，如亲子鉴定、个体识别等。
测植物dna多态性是以条带数最多的为参照吗
RAPDs标记 随机扩增多态性（Random Amplified PolymorphicDNA，RAPDs）标记是Williams等于1990年建立的通常以1O碱基的寡核苷酸序列为引物，对基因组DNA随机扩增，从而得到多态性图谱作为遗传标记的方法。
限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism）：由DNA的多态性，致使DNA分子的限制酶切位点及数目发生改变，现在多采用PCR-RFLP法进行研究基因的限制性片段长度多态性.单链构象多态性（SSCP）：是一种基于单链DNA构象差别的点突变检测方法。
种子蛋白的多态性可以用位点/等位基因（共显性）来解释，但与同工酶标记相比，种子蛋白检测速度较慢，并且种子蛋白基因往往是一些紧密连锁的基因，因此难以在进化角度对其进行诠释（Stegemann and Pietsch，1983）。同工酶标记是DNA分子标记出现前应用最为广泛的遗传标记类型。
④多态性高，自然存在许多等位变异。⑤有许多标记表现为共显性，能够鉴别纯合基因型和杂合基因型， 提供完整的遗传信息。⑥DNA 分子标记技术简单、快速、易于自动化。⑦提取的DNA 样品，在适宜条件下可长期保存，这对于进行追溯性或仲裁性鉴定非常有利。
随机扩增多态性DNA的介绍
随机扩增多态 DNA （randomly amplified polymorphic DNA， RAPD），是美国学者Williams和Welsh于1990年首先提出的该技术是通过分析DNA的PCR产物的多态性来推测生物体内基因排布与外在性状表现的规律的技术。
RAPD标记（Random amplifiedpolymorphim DNA ， RAPD）是由美国人Williams和Welsh等于1990年利用PCR技术发展起来的一种DNA多态性标记。
RAPDs标记 随机扩增多态性（Random Amplified PolymorphicDNA，RAPDs）标记是Williams等于1990年建立的通常以1O碱基的寡核苷酸序列为引物，对基因组DNA随机扩增，从而得到多态性图谱作为遗传标记的方法。
【答案】：常见的DNA指纹技术有限制性片段长度多态性、DNA指纹图谱、随机扩增多态性DNA。（1）限制性片段长度多态性 真核生物的DNA分子很长，在遗传过程中DNA碱基由于替换、重排、插入、缺失等原因，在子代DNA中会引起差异形成多态性。
扩增产物片段的多态性反映了基因组DNA的多态性。如果基因组在这些区域内发生DNA片段插入、缺失或碱基突变就可能导致这些特定结合 位点的分布发生相应的变化，而使PCR产物增加、缺少或发生分子量的改变。因此，通过对PCR产物的检测即可测出基因组DNA在这些区域的多态性。
随机扩增多态性（RAPD）标记：RAPD是通过短的随机引物扩增个体基因组DNA体 现多态性 扩增片段长度（AFLP）多态性标记：AFLP是将PCR技术与RFLP结合的一种方法，通过对基因组DNA酶切片段的选择性扩增来检测DNA酶切片段长度的多态性。
如何用dnasp分析多态性原理是什么
1、扩增产物片段的多态性反映了基因组DNA的多态性。如果基因组在这些区域内发生DNA片段插入、缺失或碱基突变就可能导致这些特定结合 位点的分布发生相应的变化，而使PCR产物增加、缺少或发生分子量的改变。因此，通过对PCR产物的检测即可测出基因组DNA在这些区域的多态性。
2、遗传多态性，尤其是单核苷酸多态性（SNP）/： 在生物群体中，同基因组存在两个或更多等位基因（频率0.01）的现象，构成了遗传多态性。SNP的形成源于基因突变，如单个核苷酸的替换、插入或缺失。SNP在基因组中尤其常见，如CG区段的C-T转换，由于甲基化的C容易脱氨成为T。
3、选择Analysis——Fu and Li 如果要计算window，修改window length和step size，点击ok即可完成计算每个群体需要单独文件分别计算.值得注意的是DNAsp不能计算单个位点的值，在window的计算上如果要和染色体位置吻合，则输入的序列就是全染色体序列（即包括没有多态性的全部位点），这样对于大物种来说就很麻烦。
4、单核苷酸多态性分析是指在基因组上单个核苷酸的变异，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。服务项目有TaqMan探针法，SNaPshot法，HRM法，Mass Array法和Illumina BeadXpress法。
5、HHH3指不同的样本，以H1的序列为参考，其它样本里小点说明和H1是一样的，不一样的就写出来是什么碱基，上面的数字不知道什么意思。什么软件不清楚，不过这种图用能比对的软件都能做出差不多的来。